- эпидемическим клоном
Эпидемический клон — генетически близкая, клонально происходящая популяция микроорганизмов, представленная одним или несколькими вариантами возбудителя, которые связаны с развитием эпидемиологически объединённых случаев инфекции. Его распространение может охватывать несколько регионов, стран или континентов. При подтверждении клонального происхождения используют методы молекулярно-генетического типирования: секвенирование генома, MLST, SNP-анализ, PFGE и другие подходы.
Термин «экзотический штамм» указывает преимущественно на занос возбудителя на неэндемичную территорию, «эндемический штамм» — на длительно циркулирующий в определённой местности вариант. Клональный комплекс является более широкой генетической группой близкородственных штаммов, а изолятом называют культуру микроорганизма, выделенную от конкретного пациента, носителя или объекта внешней среды.
| Термин | Основная характеристика | Пример эпидемиологического значения |
|---|---|---|
| Эпидемический клон | Клонально родственная линия возбудителя, связанная с группой случаев | Распространение одного варианта инфекции в нескольких странах |
| Экзотический штамм | Вариант возбудителя, ранее не циркулировавший на данной территории | Завоз инфекции из другого региона |
| Эндемический штамм | Штамм, стабильно присутствующий в определённой географической зоне | Постоянная местная циркуляция возбудителя |
| Клональный комплекс | Совокупность генетически близких, но не обязательно идентичных линий | Группировка штаммов по данным MLST |
| Изолят | Конкретная культура микроорганизма, выделенная из исследуемого материала | Изолят бактерии из крови пациента или образца окружающей среды |
Аттестационные тесты по специальности «эпидемиология» с ответами.